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생명과학실험 A+) 생물정보학 실습 결과 레포트

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최초등록일 2022.06.29 최종젿작일 2020.11
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생명과학실험 A+) 생물정보학 실습 결과 레포트
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    소개

    "생명과학실험 A+) 생물정보학 실습 결과 레포트"에 대한 내용입니다.

    목차

    1. 실험 제목

    2. 실험 목적

    3. 실험 원리
    1) 생물정보학
    2) NCBI(미국 국립생물공학정보비바카지노 Viva)
    3) BLAST
    4) BLOSUM
    5) 신종코로나바이러스 종류

    4. 실험 방법

    5. 실험 결과

    6. 고찰

    7. 참고문헌

    본내용

    1. 실험 제목
    생물 정보학 실습

    2. 실험 목적
    웹 기반 데이터베이스를 생물학 연구에 어떻게 이용하는지 체험해보고 생명정보학을 이해한다.
    -생물정보학 학문을 이해하고 생물정보학 Tool을 사용하는 방법을 익힌다.
    -생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하고 어떤 서열인지 탐구한다.
    -생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해본다.

    3. 실험 원리
    1. 생물정보학
    -정의: 생물학적인 문제를 컴퓨터를 이용해 연구하는 모든 분야를 포함하는 학문이다.
    -용도: 유전체 서열에서 유전자를 찾아내고 데이터베이스 자료왿 비교해 유사성 정도를 확인하며 유전자 산물의 구조, 기능을 예측하고 진화적인 관계를 유추한다. 그 외에도 서열 정렬, 유전자 조합, 단백질 구조 정렬, 유전자발현의 예측 등 다양하다.
    -발생배경: 비교유전체학, 단백질체학, 전사체학 등의 발달을 위해서는 많은 양의 정보를 저장, 비교, 예측할 수 있는 프로그램이 필요하다. 이에 수학, 통계학, 생화학 등을 기초로 한 컴퓨터 작업과 생물학의 만남인 생명정보학이 등장했다.
    -하위 분야: 유전체학, 변이체학, 단백체학, 상호작용체학, 다중체학 등

    참고자료

    · 남석현,민철기/일반생물학씄험/범문에듀케이션/2019/p.131-136
    · 위키피디아/생물정보학 https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%83%9D%EB%AC%BC%EC%A0%95%EB%B3%B4%ED%95%99 (20.09.23)
    · 위키피디아/NCBI
    · https://ko.wikipedia.org/wiki/%EB%AF%B8%EA%B5%AD_%EA%B5%AD%EB%A6%BD%EC%83%9D%EB%AC%BC%EA%B3%B5%ED%95%99%EC%A0%95%EB%B3%B4%EC%84%BC%ED%84%B0 (20.09.24)
    · BLAST https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
    · BLOSUM, EMBOSS Needle https://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/
  • Easy Ai 요약

    이 문서는 생물정보학 실습을 통해 웹 기반 데이터베이스를 생물학 연구에 어떻게 활용하는지 체험하고 생명정보학을 이해하는 것을 목적으로 한다. 먼저 생물정보학의 정의왿 용도, 발생배경, 하위 분야 등을 학습한다. 이어서 NCBI왿 BLAST, BLOSUM 등 생물정보학 도구의 사용법을 익힌다. BLAST 실습에서는 4개의 유전자왿 1개의 단백질 서열을 준비하여 BLAST 프로그램을 통해 동정한 후 해당 서열이 어떤 코로나바이러스에 해당하는지 분류한다. BLOSUM 실습에서는 Human-SARS-CoV-2, Bat-RaTG12, Pangolin-CoV, Human-SARS-CoV, Bat-SARS-CoV-related 바이러스의 아미노산 서열을 비교 분석하여 Human-SARS-CoV-2왿 가장 유사한 바이러스를 찾아낸다. 실험 결과 천산갑 CoV가 가장 코로나19 바이러스왿 유사한 아미노산 서열을 가진 것으로 나타났다. 그 다음으로는 Bat-RaTG12, Bat-SARS-CoV-related, Human-SARS-CoV 순으로 유사성이 높았다. BLOSUM 매트릭스 옵션에 따라 유사성 값이 다르게 나타났는데, 이는 각 옵션의 용도가 다르기 때문이다. 이번 실습을 통해 생물정보학 학문과 도구 사용법을 익히고 코로나바이러스 종류를 분석할 수 있었다. 최근 확산세가 심각한 코로나바이러스 문제를 직접 다루어볼 수 있어 의미 있는 경험이었다.
  • 자료후기

      Ai 리뷰
      생물정보학 실습을 통해 웹 기반 데이터베이스를 생물학 연구에 활용하는 방법을 습득하고 코로나바이러스 종류를 분석하였다.
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