[A+ 과제] 생��실2 보고서 Gene Expression Analysis and Gene Set Enrichment Analysis

Ⅰ. 실험 제목
Gene Expression Analysis & Gene Set Enrichment Analysis

Ⅱ. 용어 설명
가. 전사체 데이터
유전 요인의 중요성이 부각됨에 따라 의료 분야에서는 사람들의 유전적 성향을 파악하여 질병을 예측, 예방하고, 개인의 유전정보를 기반으로 한 맞춤 의료 서비스에 관한 관심이 높아지고 있다. 맞춤 의료 서비스를 제공하기 위해서는 사람의 유전정보를 분석해야 하는데, 이 경우 전사체 (transcriptome: 세포나 조직에서 한순간 발현되는 전체 RNA의 모음을 의미한다. 이 RNA들을 이용하여 조직에 따라 발현되는 유전자들의 정보를 얻을 수 있다) 분석을 이용할 수 있다. 전사체 분석을 통해 정상 세포왿� 비정상 세포 간의 발현되는 RNA 차이를 분석하여 질병과 관련한 유전자를 파악하고, 그에 알맞은 치료를 시행할 수 있다. 이 글에서는 전사체 분석 단계왿� 도구들을 소개하려고 한다.

전사체를 분석하기 위해서는 유전체 서열이나 RNA 서열을 크게 Sequencing (염기 서열 분석), Alignment (정렬), Analysis (분석)의 세 단계로 나눌 수 있다. 가장 먼저 Sequencing이란 A (아데닌), G (구아닌), C (시토신), T (티민)로 이루어진 유전체 서열이나 A (아데닌), G (구아닌), C (시토신), U (우라실)로 이루어진 RNA 서열을 사람이 이해할 수 있는 기호로 번역하는 단계이다. 이 번역 기능을 수행하는 기기들은 한 번에 읽어 들일 수 있는 서열의 길이가 짧게 제한되어 있다. 따라서 작은 조각으로 나누게 되는데 이 서열 조각을 read라고 한다. 전사체 분석에서는 세포에서 발현된 RNA를 적당한 길이로 잘라 read를 만들고, read들의 각 base가 어떠한 염기로 이루어졌는지를 파악한다. Sequencing 중 RNA를 대상으로 하는 방법을 RNA_Seq이라고 한다.