Peptide 질량분석

1. 단백질
단백질은 20종류의 아미노산들이 여러 개 연결된 폴리펩타이드 사슬이다. 펩타이드(peptide)란 둘 이상의 아미노산이 탈수축합반응을 통해 결합된 것으로, 한 쪽 아미노산의 아미노기왿� 다른 쪽 카복실기로 구성된다. 중심 탄소 원자는 이외에도 수소 하나왿� R기(R-group)이 결합되어 있으며, 이 R기가 아미노산의 종류를 특정한다. 펩타이드를 형성하는데 사용된 단량체를 각각 잔기(residue)라고 하며, 이 잔기들이 백 개 이상정도 결합한 고분자를 폴리펩타이드(polypeptide)라고 부른다. 이 사슬에 잔기들이 배열되어 있는 순서를 일차 구조, 사슬 자체가 형성하는 구조를 이차 구조, 사슬들이 접히며 만들어지는 삼차원 형태를 삼차 구조, 폴리펩타이드들이 모여 형성하는 또 다른 모양을 사차 구조라고 한다.
2. MALDI-TOF 질량분석법
물질의 몰질량을 측정하는 기존의 방법은 시료를 기체상 이온으로 바꾸어 각 이온들의 질량/전하수 값을 측정하는 질량 분석법이다. 그러나 단백질과 같은 고분자의 경우, 큰 분자를 작게 나누지 않고서 고분자의 기체상 이온을 만들기가 어려워, 기반-이용 레이저 탈착/이온화 법(MALDI, Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization)이 개발되었다. 이 MALDI법과 비행 시간(TOF, Time Of Flight) 이온 검출기를 결합시킨 질량 분석법을 MALDI-TOF라고 한다.
분석 물질에 자외선을 흡수하는 역할을 하는 matrix를 넣어주고 레이저로 적외선 또는 자외선을 쪼여주면, matrix가 기화되어 분석 물질을 포함한 상태로 기체상으로 확산된다. 분석 물질 사이의 결합이 억제되면서 이 기체상 시료는 전하를 띠는 이온이 되고, 여기에 전압을 걸어주면 이온들이 분석계 안으로 들어가게 된다. 전기 퍼텐셜 차이에 의해 초반 거리 d에 걸쳐 가속된 이온들은 길이가 l인 표류 영역을 통과하며..

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