이 실험을 통해 플라스미드 DNA를 추출하고 전기영동을 통해 플라스미드 DNA의 형태를 관찰할 수 있었습니다. 플라스미드는 생장에 필수적인 염색체 DNA와 물리적으로 분리되어 있는 대표적인 에피솜 DNA 분자로, E.coli 세균에서 플라스미드를 추출하여 DNA를 관찰했습니다. 실험에서는 여러 가지 버퍼를 사용했는데, 이는 플라스미드 DNA 추출을 위한 것입니다. 실험 결과 3kb와 10kb 부분에서 플라스미드 DNA가 관찰되었으며, 3kb 부분은 Linear DNA, 10kb 부분은 Open-circular DNA로 확인되었습니다. Linear DNA의 양이 더 많은 것으로 나타났습니다.

원심분리기는 물질을 원심력을 이용하여 분리하는 장치로, 질량이 클수록 침전 위치가 아래로 내려갑니다. 배양한 E.coli 세균을 원심분리하여 위에 있는 배양액은 제거하고 질량이 큰 균체만 실험에 사용했습니다. 그 후 버퍼를 넣고 원심분리하면 염색체 DNA는 단백질, SDS, potassium acetate 등과 엉켜 하얀 침전물 형태로 가라앉고, 질량이 가벼운 플라스미드 DNA가 맑은 상층액으로 존재하게 됩니다. 이를 통해 질량 차이로 침전 위치를 파악하여 플라스미드 DNA만을 정확히 분리해낼 수 있습니다.

분리한 플라스미드 DNA에 TAE 버퍼와 6X loading 버퍼를 넣어 전기영동을 실시했습니다. 6X loading 버퍼는 시료를 well 속에 잘 가라앉히고 buffer 안에 bromophenol blue가 들어있어 전기영동 시 이동을 확인할 수 있습니다. TAE 버퍼는 pH로 인한 변성을 막아줍니다. 전기영동 결과, 플라스미드 DNA의 형태에 따라 band 형태가 다르게 나타났으며, 빠르기는 Open-circular DNA < Linear DNA < supercoiled DNA 순으로 관찰되었습니다.